用SAM法分离谷子SSR位点的研究

来源 :河南农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yuanxb2008
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首次将SAM(选择扩增微卫星)法用于谷子SSR位点的分离,共获得163个含有SSR序列的克隆,其中uniqueSSR106个,占所有SSR序列的65%,60个SSR序列的3’端成功设计特异引物,占uniqueSSR的56%。这60个SSR序列中,55个为完整型重复;5个为复合型重复,由2种不同的重复单元组成,没有发现不完整重复类型。同时讨论了SAM法在应用过程中应注意的一些关键技术环节,如接头连接、核苷酸选择策略、特异引物设计原则,及该方法存在的一些不足,如获得SSR重复次数少、一端侧翼序列缺失对扩增多态
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