Gene Expression Data Classification Using Consensus Independent Component Analysis

来源 :Genomics Proteomics & Bioinformatics | 被引量 : 0次 | 上传用户:yukon_hawk
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We propose a new method for tumor classification from gene expression data, which mainly contains three steps. Firstly, the original DNA microarray gene expression data are modeled by independent component analysis (ICA). Secondly, the most discriminant engenassays extracted by ICA are selected by the sequential floating forward selection technique. Finally, support vector machine is used to classify the modeling data. To show the validity of the proposed method, we applied it to classify three DNA microarray datasets involving various human normal and tumor tissue samples. The experimental results show that the method is efficient and feasible. Firstly, the original DNA microarray gene expression data are modeled by independent component analysis (ICA). Secondly, the most discriminant engenassays extracted by ICA are selected by To show the validity of the proposed method, we applied it to classify three DNA microarray datasets involving various human normal and tumor tissue samples. The experimental results show that the method is efficient and feasible.
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