本届花博会主办方在户外展场运用了丰富多彩的植物配置,植栽的种类约有1600种、3300个品种。为确保台湾花农权益,会场所需花卉植栽90%以上使用台湾花卉。花博会共有超过185种的台湾原生或特有种植物。在新生公园区闽式庭园,选用了穗花棋盘脚、台湾榉、台湾鸢尾、台湾棒花赤楠、台湾桫椤、台湾金狗毛蕨、台东火刺木、台湾山茶花等台湾原生物种。在串连三大公园区的花之隧道,则种植了台湾肾蕨等29种蕨类、湿生植物、天南星等植物,体现了台湾的花卉特色。新生公园区未来馆内,也选用如台湾金狗毛蕨、台湾凤尾蕨、尖叶耳蕨、卤蕨、兰屿观音坐莲、台湾红豆杉、流苏、台湾香兰、台湾一叶兰、屏东石豆兰、覆叶石松、兰屿海桐、台湾野牡丹藤、台湾野百合、台湾粗榧、台湾梭罗木、玉山抱茎籁萧等台湾原生物种。其中在珍稀植物区,更以台湾特有、稀有植物为主,极大地凸显了台湾丰富的植物资源与其多样性。