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根据长江巫山段六个断面2005年和2007年枯、平、丰的水质监测结果，通过对培石断面2005年和2007年的对比，可以看出三期蓄水前后长江水质比较稳定，仍为Ⅱ类水质。通过对2005年和2007年培石断面的各实测指标比较分析可以看出DO、CODMn、BOD5、TP指标2007年均出现不同程度的下降，而NH3-N、TN则呈现升高的趋势。但各支流由于受干流回水顶托影响，水环境趋于复杂，部分河段出现水华现象，需引起高度重视。