【摘 要】
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逐个SNP的全基因组关联分析中的统计量不仅依赖于遗传效应,而且依赖于SNP,因此统计量不能直接应用于推断无遗传效应的零假设中。检测不同样本的QTN,常用的统计量除了卡方统计
【机 构】
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黑龙江八一农垦大学理学院,集美大学水产学院,黑龙江八一农垦大学动物科学技术学院
【基金项目】
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2017 年大庆市指导项目(采用随机森林法解析猪的经济性状位点:zd-2017-76),2017 年校内培育课题(动物全基因组关联分析的分层求解策略---基于随机回归模型:XZR2017-13).
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逐个SNP的全基因组关联分析中的统计量不仅依赖于遗传效应,而且依赖于SNP,因此统计量不能直接应用于推断无遗传效应的零假设中。检测不同样本的QTN,常用的统计量除了卡方统计量,还有统计量、F统计量和标准正态统计量。首先给出了各个统计量之间的关系,接下来针对冗余参数背景下的全基因组关联分析,提出了检验统计量阈值的快速计算方法。再次利用获得的高通量SNP的统计概率构建卡方统计量,进而估计临界值。最后模拟不同样本的阈值并与文献上提出的阈值算法比较。大量模拟实验证明,提出的方法快速而且有效。
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