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阔克锌铜矿位于西伯利亚板块阿尔泰陆缘活动带克兰古生代火山弧中部的阿勒泰火山-沉积盆地中，为活动大陆边缘陆内裂谷火山盆地，成矿区带属阿尔泰成矿带克兰多金属成矿亚带，是金、铁、铜、铅锌多金属重要成矿远景区。矿体赋存于中泥盆统阿勒泰组中，为一套浅变质的海相碎屑岩夹碳酸盐岩、硅质岩建造，局部夹中基性火山岩及凝灰岩；矿体围岩主要为矽卡岩，矿体表现出一定的层位控矿特征。