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基于隐马尔可夫模型的DNA序列识别

来源 :华南理工大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户：woshichuanqi007

【摘 要】

：

利用隐马尔可夫模型训练中不同结构的DNA序列的L值分布范围不同的特点,对传统多类投票模型进行改进,提出一种优于传统算法的快速训练算法,该算法只需训练出一类隐马尔可夫模

【作 者】

：

罗泽举 李艳会 宋丽红 朱思铭 

【机 构】

：

重庆工商大学计算机科学与信息工程学院,中山大学数学与计算科学学院,重庆工商大学实验实习中心

【出 处】

：

华南理工大学学报(自然科学版)

【发表日期】

：

2007年8期

【关键词】

：

隐马尔可夫模型 DNA序列 内含子 外显子 识别 快速训练算法 hidden Markov model DNA sequence intron exon 

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利用隐马尔可夫模型训练中不同结构的DNA序列的L值分布范围不同的特点,对传统多类投票模型进行改进,提出一种优于传统算法的快速训练算法,该算法只需训练出一类隐马尔可夫模型参数.对DNA内含子和外显子序列进行识别,平均识别率达到了90.8%.与支持向量机相比,隐马尔可夫模型在解决多分类问题方面具有优势,不但计算时间少,而且识别率高.

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