应用生物信息学筛选大肠癌转移相关小分子化合物

来源 :西安交通大学学报(医学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:fengyun163
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目的筛选并分析与大肠癌转移相关的小分子化合物。方法首先通过大肠癌早期转移组织表达谱数据与正常大肠组织数据进行统计学比较,筛选出差异表达基因,再通过差异表达基因与小分子的对应模式筛选出与大肠癌早期转移相关的小分子化合物,最后通过分析小分子化合物的靶蛋白在大肠癌疾病类中的富集情况,筛选靶蛋白中与大肠癌相关的部分靶蛋白,结合大肠癌表达谱的表达情况以及小分子化合物与靶蛋白的结合情况筛选最相关的靶蛋白并进行网络调控情况分析。结果通过小分子化合物的富集分析,tanespimycin得分最高,并且其靶蛋白在大肠癌疾病类
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