论文部分内容阅读
目的
比较不同年代分离自澳大利亚、中国海南地区7株ST562型类鼻疽伯克霍尔德菌（类鼻疽伯克菌）的同源性，并分析其传播来源。
方法利用生物信息学方法提取ST562型类鼻疽伯克菌澳大利亚临床株MSHR5858、中国海南历史菌株350105基因组中SpeⅠ限制性酶切片段指纹谱、多位点可变数目串联重复序列多态性指纹（MLVA-4）等遗传特征，并与近年分离的5株海南ST562型临床株的脉冲场凝胶电泳（PFGE，SpeⅠ酶切）、MLVA-4分子分型结果相比较。同时分析MSHR5858与350105在基因组水平的共线性及同源性。
结果5株海南ST562型临床株的PFGE带型相同（相似度>97%）且与澳大利亚临床株MSHR5858的SpeⅠ限制性带型一致；澳洲临床株（MSHR5858）与海南历史菌株（350105）基因组中SpeⅠ限制片段数分别为31和34，其中31个片段的长度一致。5株海南ST562临床株的MLVA-4型别各不相同，但HPPH43（MLVA-4指纹谱：10，8，10，8）与MSHR5858（10，8，8，6）在2341 k、1788 k两个位点重复数相同；HK003（11，8，15，7）、HK061（11，8，17，7）与历史菌株350105（11，8，11，8）在此二位点重复数也相同。此外，350105与MSHR5858在基因组水平具有良好共线性，共有基因占绝大部分，提示来源一致。
结论分离的7株ST562型类鼻疽伯克菌（包括中国海南临床分离株、历史菌株及澳大利亚临床分离株）遗传特征一致，且ST562型近年流行株与历史菌株350105可能具有同源关系。