三种非结核分枝杆菌esxB基因的克隆与序列分析

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为了探讨非结核分枝杆菌中EsxB蛋白的生物学功能,试验以实验室分离的母牛分枝杆菌、新金分枝杆菌和耻垢分枝杆菌为对象,克隆了esxB基因,应用生物信息学方法进行系统发生分析,对EsxB蛋白进行生物学特性、保守区分析以及抗原表位、可能的三级结构预测。结果表明:克隆的3种非结核分枝杆菌的esxB基因大小分别为309 bp、303 bp、294 bp,推导的氨基酸序列与Gen Bank中登录的相应菌种的氨基酸序列同源性分别为95%或97%、100%、100%;属于WXG100蛋白超家族中CFP-10亚家族成员,具有该亚家族保守的α-螺旋和Yxxx D/E序列;预测到3条肽链线性B细胞表位各1个,T细胞表位各4个、9个、5个,部分T细胞表位与结核杆菌CFP10的CD8+T细胞表位有5~6个共同氨基酸。
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