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中国水产科学研究院南海水产研究所是海区综合性水产科研机构,以应用研究和应用基础研究为主,主要从事南海渔业资源的合理开发和有效利用及其增养殖理论和方法的研究、海洋经济生物人工孵化、培苗、养殖技术的研究、近海捕捞技术的改进和运洋深海捕捞技术的研究、渔场环境改道和保护的研究、新技术应用及情报研究等。