时间针灸的相关研究取得了一定的成绩,同时在研究中也存在一些问题与不足,主要表现在以下几点:理论研究数量相对较少,且缺少从医学与文化角度对时间针灸的形成、发展脉络与理论内涵的深入研究;临床研究方面对子午流注、灵龟八法关注较多,对飞腾八法与养子时刻注穴法则极少涉及;研究者对时间针灸的概念、方法不清,导致应用上的不规范甚至是错误;临床研究选取的样本量过少、缺少对照组或对照组设置不合理,以及随机对照实验的设计不够规范和严谨,不同研究者对同一疾病采取的疗效评价标准不尽统一;有关实验研究仅限于对人与动物理化指标的观察,较少涉及深层次的机制研究。今后应进一步开展理论研究、规律总结,并探索时间针灸的临床应用,总结时间针灸的应用经验,并进行更深层次的机制研究,为时间针灸理论和临床应用提供依据。