【摘 要】
：
目的探讨基于肺癌全基因组关联研究数据的遗传风险预测方法和策略。方法将肺癌GWAS数据中的南京子样本和北京子样本分别作为训练集和测试集,分别使用预测全集和最优预测子集
【机 构】
：
南京医科大学公共卫生学院生物统计学系
论文部分内容阅读
目的探讨基于肺癌全基因组关联研究数据的遗传风险预测方法和策略。方法将肺癌GWAS数据中的南京子样本和北京子样本分别作为训练集和测试集,分别使用预测全集和最优预测子集两种策略,比较三种预测方法在不同连锁不平衡结构(LD)和初筛检验水准(α)下的预测准确度。结果 w GRS在高LD结构下,随着-log(α)增大,预测准确度呈现上升趋势;RF和SVM对LD结构不如w GRS敏感,但三种方法在低LD结构(r2<0.2)下预测准确度优于高LD结构;w GRS方法下最优预测子集效果略优于预测全集效果,SVM下子集效果与全集近似,但略逊于全集,RF下子集效果则不如全集,且差距较大。结论基于LD结构修剪SNP位点和选择适当的初筛水准可以提高遗传风险预测准确度,此时w GRS方法预测效果优于SVM和RF。
其他文献
目的:探讨应用腹腔镜治疗阑尾周围脓肿的手术方法和手术效果。方法:回顾分析2007年6月至2009年8月为21例患者施行腹腔镜阑尾周围脓肿手术的临床资料,其中一期阑尾切除加脓肿
目的 :评价腹腔镜诊断治疗继发不孕症的临床价值。方法 :分析应用腹腔镜诊断和治疗继发不孕症 98例的临床资料。结果 :腹腔镜检查发现盆腔器质性病变 93例 ,检查阳性率为 94
目的评价广西67家县级妇幼保健院的工作效率,分析其卫生资源配置合理性。方法运用相关分析、变异系数、聚类分析筛选出具有代表性和特异性的评价指标。运用DEA和RSR两种方法
<正>目前,我国超市型连锁零售企业已取得了巨大的发展,而大学校区也逐步成了各零售商业企业的竞争之地。上海教育超市在面临激烈竞争的环境下,怎样利用地域和成本优势,做大做
<正> 第一次结婚,妻子是张锡媛张锡媛原籍河北省房山县良乡,生于1907年,在直隶省第二女子师范学校读书,她的父亲张镜海在铁路工作,曾任良乡火车站站长,思想非常进步,参加过"
商业广告的主要目的是激发潜在顾客购买产品的欲望。因此,商业广告翻译的成败直接关系到中国的产品能否走出国门并占据国外市场。应针对英文广告的用词特点及文化差异对商业
<正>玉溪市位于云南省中部、北距巨昆明80公里,面积960平方千米,与普洱市、红河及楚雄州相毗邻。说是毗邻,实际上由于地处云贵高原西缘,山地、峡谷、高原、盆地交错分布,又有
做好资产管理工作、实现非金融资产管理公司的价值增值是资本运作的必由之路。资本运作是复杂的系统工程,需要各环节配合才能实现价值最大化。资产管理公司的运作在于利用比
采用当年生半木质化枝条作为杂交榛子品种苗的繁殖材料,用适宜浓度的IBA或IBA+ABT6混合液做生根促进剂,锯沫作为填充物,管理期间保持锯沫湿润,110～120d即可成苗。
<正>民主集中制,是马克思主义的无产阶级政党的根本组织原则和组织制度,它是由无产阶级政党的性质决定的。从列宁首先提出并使用民主集中制的概念,到中国共产党坚持并发展民