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目的
检测长链非编码RNA(lncRNA)在转化生长因子β(TGF-β)诱导的肾小球系膜细胞增生中的改变,探讨lncRNA在系膜增生性肾小球肾炎发病中的作用。
方法用TGF-β刺激建立系膜细胞增生模型。采用细胞增殖实验筛选TGF-β诱导肾小球系膜细胞增生的最佳浓度;用芯片技术筛选TGF-β刺激组与对照组有差异表达的lncRNAs;采用生物信息学分析法分析lncRNAs芯片结果,用RT-PCR法验证差异表达的lncRNAs,再根据生物信息学分析结果推测靶基因,用RT-PCR法验证。
结果细胞增殖实验结果显示,10 ng/ml TGF-β为刺激细胞增殖最佳浓度。芯片筛选结果显示,TGF-β刺激组和对照组约30 000多个lncRNAs表达,TGF-β刺激组有5550个lncRNAs差异表达于对照组,其中119个和147个lncRNAs上调或下调超过2倍。根据lncRNA筛选原则选取部分lncRNAs用RT-PCR法验证。结果提示:与对照组相比,TGF-β刺激组细胞uc.60、MRAK079149、MRAK029456、XR_005507、XR_007641、uc.14和uc.412的表达明显上调;BC088254、DQ402472、BC098733、BC158832、BC098746表达明显下调,与芯片检测结果一致。生物信息学分析结果显示uc.412和MRAK079149的下游靶基因分别为抗凋亡转录因子(AATF)和NimA相关激酶8(NeK8),RT-PCR验证结果提示:与对照组比较,TGF-β刺激组AATF和NEK的表达显著上调(P<0.05)。
结论体外TGF-β诱导的系膜细胞增生模型中存在lncRNAs的差异表达。