野生树鼩与人工饲养树鼩消化道不同部位微生物组成的比较研究

来源 :中国比较医学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：t920215

【摘要】

：

目的以树鼩为研究模型,探讨野生树鼩与人工繁育树鼩不同肠段的菌群组成。方法分别收集3只健康野生及人工繁育树鼩七个胃肠段样本,提取细菌总DNA,采用高通量测序技术对16S rRN

【作者】

：

李艳艳杨凤梅王俊斌陈丽雄段素琴杨亚平刘雨和占龙

【机构】

：

中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所

【出处】

：

中国比较医学杂志

【发表日期】

：

2020年4期

【关键词】

：

肠道菌群树鼩 16SrRNA测序肠段 intestinal microflora tree shrews 16srRNA sequence intestin

【基金项目】

：

中国医学科学院协同创新项目(2016-I2M-2-001,2018-I2M-3-002),昆明市科技创新和服务能力提升计划重点项目(2016-2-R-07674),中央级公益性科研院所基本科研业务费(2016ZX310179-4),云南省重大科技专项(2017ZF020),云南省科技创新人才计划(2015HC027)

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目的以树鼩为研究模型,探讨野生树鼩与人工繁育树鼩不同肠段的菌群组成。方法分别收集3只健康野生及人工繁育树鼩七个胃肠段样本,提取细菌总DNA,采用高通量测序技术对16S rRNA基因的V3-V4高变区测序,分析比较菌群结构及多样性。结果不同肠段Alpha指数多样性分析显示野生组与人工繁育组树鼩在盲肠和胃Shannon指数存在显著差异(P<0.05)。野生组与人工繁育组各肠段微生物组成存在较大差异,门水平上,野生组直肠、结肠、盲肠及胃四个部位中Firmicutes菌门的平均占比显著高于人工繁育组(P&l

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