基于混合核和加权SVM的microRNA前体识别算法

来源 :科学技术与工程 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ramondwang
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
摘要MicroRNA是一种单链RNA小分子,是由具有发夹结构的、更长的单链RNA前体经加工后生成。相比microRNA序列本身而言,其前体序列和二级结构隐含了更多的可识别特征与信息。因此可利用加权Levenshtein距离,结合其前体序列和二级结构构造一个指数核函数。结合SVM构造识别模型,鉴别真假前体。在用5折叠法得到最佳识别模型后,对人类数据进行测试。实验结果显示,新方法表现出了较好的识别精度,和较高的敏感性与特异性。
其他文献
一、现状近几年来。安阳县针对农村外出人员增多、不少土地粗放经营的状况及一些种粮大户和个体经营者的需求,大力鼓励发展土地流转。随着土地流转的加快.一些农业产业化龙头企
在前人研究的基础上发展了静力弹塑性分析方法,进一步完善了基于结构动力性质的振型分解的Pushover方法,即MPA方法,以提高Pushover的分析精度.并通过算例分析证明这种方法的
近年来随着我国科学技术的快速发展,我国在临床医学领域也取得了较大的进步,从器官移植、癌症靶向治疗、心脑血管中药疗法到神经网络再生移植辅助、造血干细胞移植等,我国在
在固体与分子经验电子理论(EET)框架下,利用键距差(BLD)方法,选取可能的一种碳化硼晶体结构作为计算模型。计算得到符合EET理论判据的碳化硼晶体的价键电子结构。基于价键电子结
应力波反射法是在混凝土桩基质量检测领域广泛应用的低应变动力检测方法,在深层搅拌桩中的应用尚处于探索阶段。基于低应变反射波时域、频域曲线分析原理,对桩身无缺陷和存在各
教学评价是教学管理过程中的重要环节,从教务管理系统数据库存储的大量数据中找出数据间的关系是当前教学管理的关键.本文以SQLServer2005为平台,采用Microsoft决策树算法对枣庄
【正】2008年是学习、宣传、贯彻党的十七大精神、全面落实科学发展观的重要一年。这一年,在中华民族伟大复兴的征程上留下了浓墨异彩:北京奥运,举世好评;神七飞天,全国欢腾;
新开发的高流动性混凝土使用的增粘剂名为“对糖胶”与以往使用的“微浪胶”均为商品名,但化学结构不同,它具有以往所有增粘剂不具备的特有的粘度特性。“对糖胶”与“微浪胶”
钙是动物生长发育所必需的营养物质,供应不足或过多均会影响动物的生产性能。日粮中含过高浓度的钙或高度可溶性钙会对其他营养物质产生抗营养作用,然而添加植酸酶尤其是有效
以太原市太行路高填方路段为研究对象,通过沉降观测,研究黄土地区高填方路堤的沉降过程及其发展变化规律,从而了解到影响高填方路堤沉降的影响因素。由于该高填方路堤地形的