按照中科院党组提出的“开放兴院、民主办院、人才强院”发展战略，遗传发育所领导班子不断探寻科学、有效的路径，围绕更好地发挥“所长负责制、党委的政治核心、职代会的民主管理、学术委员会（或战略研讨会）的学术评议”四位一体的研究所管理体系功能，从组织和管理上保证出成果、出人才、出思想，为构建现代研究所制度和创新生态系统进行积极探索。
　　理解各自职责，分工明确与整体协同相统一
　　“四位一体”研究所管理体系是研究所党政领导正确行使权力和履行义务、全面做好民主管理和监督的重要制度保障。在所长与党委之间，从组织原则上讲，是个人与组织的关系;从职责分工上讲，是所长领导科研工作和党委把握方向的关系;从工作关系上讲，是所长总体负责和党委监督保障的关系。科研单位的所长和党委所代表的根本利益是一致的，目标是共同的。在研究所的实践中，研究所所长兼任研究所党委委员，研究所党委书记兼任第一副所长。学术委员会（或战略研讨会）、职代会与所务会、党委会共同研究加强研究所整体发展的统筹安排，规避研究所内同质竞争，以不断提升科研核心竞争力。
　　构建刚性框架，科学性与民主性相统一
　　建立完善的研究所管理制度，是实施研究所“民主管理”的基础，也是践行院党组“民主办院”的关键。管理结构的转变，会使科研效率由此取得实质性的进步，否则，单纯加强状态与绩效的管理，只是治标不治本。
　　“科学性”和“民主性”是其中两个最基本的要素。构建民主管理制度，主要包括：职代会制度、民主评议干部制度、情况通报制度、合理化建议制度等。在研究所实践中，刚性框架毫无疑问还应包括战略（规划）和评价。目前，通过研究所“一三五”（未来5年的一个研发定位、三个重大突破和五个重点培育方向）规划，带来了科研人员实质的合作、思想的交流、项目的聚集。再如，最近我们也在努力探索新型考核机制，包括科学评价、科研任务、教学任务、公益服务等指标体系建设考核等。
　　实施柔性管理，集体利益与职工利益相统一
　　研究所领导根据科研人员、支撑人员、管理人员群体的不同特点，重视运用道德引领、人格尊重、赏识激励等“柔性”化管理策略，以平等的心态看待每一位职工，规避“说教式”