牦牛miR-652靶基因预测及生物信息学分析

来源 :中国草食动物科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：huwei00

【摘要】

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为进一步探索牦牛miR-652在骨骼肌发育过程中潜在的作用机制,试验从miRbase数据库中下载已有物种的miR-652序列,与牦牛miR-652序列进行比对分析保守性,利用Targetscan软件预

【作者】

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刘东花刘丽来进成李润桦

【机构】

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甘肃省畜牧技术推广总站

【出处】

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中国草食动物科学

【发表日期】

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2021年3期

【关键词】

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miR-652 牦牛靶基因生物信息学

【基金项目】

：

甘肃省青年科技基金计划(20JR5RA576)。

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为进一步探索牦牛miR-652在骨骼肌发育过程中潜在的作用机制,试验从miRbase数据库中下载已有物种的miR-652序列,与牦牛miR-652序列进行比对分析保守性,利用Targetscan软件预测miR-652的靶基因,并与已报道的靶基因合并为靶基因集合;采用g:Profiler和KOBAS 3.0在线软件分别对靶基因集合进行GO注释和KEGG通路富集分析。结果发现:miR-652序列在各物种间高度保守性,靶基因显著富集在细胞命运决定、Notch信号通路的调节、细胞通讯的调节和细胞分化的负调节等生物

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