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显微镜已越来越多地应用到刑侦，文检等工作中，以对指纹，血迹，弹道及文书等做出正确的解析。本文描述了一种基于显微镜图像下的二维融合图的三维重建技术，该技术可以得出二维显微图像的融合图并还原出二维融合图像的三维特征。本文在分析原理的基础上，使用Direct3D在VC环境下实现了三维重建技术，使得人们能够更加直观的观察显微镜图像，做出正确的分析判断。