两个花色印度野牡丹转录组De novo数据分析

来源 :分子植物育种 | 被引量 : 0次 | 上传用户:
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
项目构建了两个花色印度野牡丹不同花期6份花瓣样品的转录组数据库,共获得387 450 968条读段(Reads),有效读段数据(Clean reads)375 952 826条,占比97.03%,其中包含54 795 712 285 nt数据信息,6个样品的高质量Clean reads比例均达95%以上;对获得的高质量序列进行组装,获得非冗余的基因(Unigene)数据54 725条,总长度56 818 948 nt,N50平均长度1 909 nt;Clean reads在Unigene上被比对到的reads数(Mapped reads)为316 210 813条,匹配率84.109 2%,能够唯一比对到的reads片段(Unique mapped reads)为296 302 103条,唯一匹配率78.813 6%。所得数据将为野牡丹属植物控制花色的相关功能基因开发、利用奠定基础。 A total of 387 450 968 reads and 375 952 826 valid reads were obtained, accounting for 97.03% of the total, Which contains 54 795 712 285 nt data. The high-quality Clean reads proportion of all 6 samples reaches more than 95%. The obtained high-quality sequences are assembled to obtain 54 725 unigene data with the total length 56 818 948 nt and N50 average length 1 909 nt. Clean reads were mapped to 316 210 813 mapped reads on Unigene with a matching rate of 84.109 2%. Uniquely aligned reads (Unique mapped reads is 296 302 103 with a unique match rate of 78.813 6%. The data will lay the foundation for the development and utilization of related functional genes controlling the flower color of genus Ornaceae.
其他文献
随着城市化进程的加快,建设项同用地日益增加,土地勘测定界工作作为报批建设用地的一项前期工作其重要性十分突出.本文结合工作实践,阐述了土地勘测定界的方法.
为探究吕家坨井田地质构造格局,根据钻孔勘探资料,采用分形理论和趋势面分析方法,研究了井田7
随着我国经济建设的迅猛发展,各个城市的大型和超高层建筑大量涌现.城市高速发展导致车满为患,再说沿海地区的人防要求,设置地下室是解决以上问题的最佳办法.
低能耗建筑的主要特征是:节约资源,减少污染;有良好的建筑形态,与自然环境和谐共存;协调好艺术美学与经济合理性;降低运行和维修费用.本文介绍了低能耗建筑设计的一些综合技
2010年,佳木斯市发生了这样一起上访事件:一国有商业企业在1998年企业改制时,按照出售合同的约定,出售价款中抵扣职工安置费资产累计848万元,企业出售后,按民营方式运营。在2
为探究吕家坨井田地质构造格局,根据钻孔勘探资料,采用分形理论和趋势面分析方法,研究了井田7
1 概念设计的重要性rn概念设计是展现先进设计思想的关键,一个结构工程师的主要任务就是在特定的建筑空间中用整体的概念来完成结构总体方案的设计,并能有意识地处理构件与结
统观网络和杂志刊物等各类媒体文章,广大的养殖户和技术人员以及专家教授对于猪场药物保健的评价褒贬不一.但是,就我们现有的养殖品种、硬件设备和从业人员的基本素质三者的匹配
现阶段,基坑支护结构的设计还处于理论计算和工程经验并重的阶段.对于基坑支护结构,通常采用经典土压力理论来进行设计计算,但这种设计方法忽略了桩土相互作用,未考虑桩体变
期刊
The estrogen receptor(ER)-related factor(ERRF)was previously reported as a novel modulator of breast cancer(Su et al.,2012).Its expression was upregulated in br
期刊
@@