【摘 要】
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半日花是半日花科的一种半灌木或灌木，间断分布于我国内蒙古和新疆地区，由于种群数量稀少，现已被列为国家二级保护植物，开展半日花种群遗传多样性和谱系地理结构的研究对于半日花
【基金项目】
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国家自然科学基金项目（31060048）资助
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半日花是半日花科的一种半灌木或灌木，间断分布于我国内蒙古和新疆地区，由于种群数量稀少，现已被列为国家二级保护植物，开展半日花种群遗传多样性和谱系地理结构的研究对于半日花的科学保护具有重要意义。本文基于叶绿体DNA片段trnc—ycf6序列分析和AMOYA发现，半日花种群的遗传变异主要存在于居群间（93％），且居群问遗传分化很高（Gst=0．71，Fst=0．93，Nst=0．92）；9个单倍型中4种为内蒙古特有，5种单倍型为新疆特有，有着显著的谱系地理学结构（Nst〉Gst）且居群问基因流较低（Nm=0．
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