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通过研究PCR反应体系（DNA、Primer、Mg^2＋、dNTP、Taq聚合酶、buffer）及退火温度对苹果自交不亲和基因（S基因）扩增结果影响的分析，构建了适合于苹果自交不亲和基因的PCR扩增程序的优化体系。结果表明：在20μL的反应体系中，模板DNA的最适含量为40ng，dNTP最适浓度为0．25mmol／L，而Primer最适浓度为0．4μmol／L，Mg^2＋的最适浓度为2．5mmol／L，Taq聚合酶最适浓度为1U，buffer最适浓度为1×buffer，最适退火温度为50℃。