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在人类历史的长河中,1.6亿年来人类与定植在胃肠道和身体其他器官内的细菌共生,共同进化,这些细菌数量巨大,达10^14以上(人体含有10^13真核细胞),包含约500~1000个种属.其宏基因大小约为自身基因的100倍[1].然而直至目前为止仅30%菌种培养成功,70%的细菌尚不能培养.这些庞大的细菌分布全身各组织器官中,其中以胃肠道定植最多.根据其空间分布肠道细菌可分成黏液层细菌和肠腔内细菌,两者在物质交换、信号传递、免疫系统发育和抵抗病原微生物入侵等方面均起到重要作用.