【摘 要】
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对于肽和蛋白质的分析鉴别,串联质谱(MS/MS)是极其重要的方法.解释MS/MS数据的一种方法是de novo序列,它正变得越来越准确和重要了.但de novo序列通常只能准确地判定序列的一
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对于肽和蛋白质的分析鉴别,串联质谱(MS/MS)是极其重要的方法.解释MS/MS数据的一种方法是de novo序列,它正变得越来越准确和重要了.但de novo序列通常只能准确地判定序列的一部分,而对于不确定的部分只能通过"质量间隙"来表示,我们称这样部分确定的序列为间隙序列标签.对于蛋白质的分析鉴别,当在数据库中查询一个间隙序列标签时,其中确定的部分应与数据库蛋白质序列完全匹配,而对于每一个质量间隙也应匹配一个氨基酸子串,这些氨基酸子串的质量和应与质量间隙的质量和相等.在这种情况之下,标准的串匹配算法已经不再适用.在本文中,我们将提出一个新的且有效的算法,用以在蛋白质数据库中找到与间隙序列标签所匹配的序列.
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