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在传统的Chou-Fasman蛋白质二级结构预测方法的基础上引入同义密码子使用的信息，计算了200个蛋白(49种全α结构蛋白，69种全β结构蛋白，38种仅α+β结构蛋白，44种α/β结构蛋白)中不同密码子对应的氨基酸形成不同二级结构(α：螺旋，β：折叠，C：卷曲)的偏向性参数．通过对这些密码子对应氨基酸二级结构偏向性的分析，得到了氨基酸二级结构偏向性分析中所忽略的同义密码子的蛋白结构信息．这些新的信息量对于指导蛋白质设计以及提高蛋白质二级结构预测的准确率有着一定的作用．