白花泡桐纤维素合成酶PfCesA2及PfCesA8基因克隆及初步表达分析

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为了获得白花泡桐纤维素生物合成途径关键酶基因-纤维素合成酶家族基因,本研究采用PCR技术和RACE技术,利用Oligo、Primer5等软件进行引物设计,从白花泡桐中克隆出纤维素合成酶基因两条,NCBI分析后,分别命名为PfCesA2 (NCBI登录号:MK340935)及PfCesA8 (NCBI登录号:MK340937).PfCesA2基因的cDNA全长4 164 bp,其开放阅读框(ORF)长度为3 273 bp,能够编码含有1 090个氨基酸的蛋白质,此蛋白质的相对分子质量为123 431.95,等电点为6.70.PfCesA8基因的cDNA全长为3 341 bp,其开放阅读框(ORF)长度为2 955 bp,能够编码含有984个氨基酸的蛋白质,此蛋白质的相对分子质量为110 241.71,等电点为6.20.二级结构分析表明二者都以α-螺旋和无规则卷曲为主.结构域和跨膜区分析表明二者在N端都含有锌指结构域,在C端都含有6个跨膜区,这些结构域能够表现纤维素合成酶的特征.系统进化树分析表明在所选取的物种当中,白花泡桐与芝麻、紫花风铃的亲缘关系较近.组织特异性分析结果表明,二者在茎中的表达量最高,根部次之,叶部最少;且在茎中,木质部的表达量高于韧皮部.说明二者可能主要参与次生壁的建成.本研究所克隆的两个基因属于白花泡桐纤维素合成酶家族基因,这在丰富该领域研究的同时,也能够为利用基因工程手段对泡桐木进行遗传改良提供重要的基因资源.
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