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本病主要宿主动物，疫源地类型及流行程度，随着不同地形地貌而异。福建19℃等温线以北的Ⅰ、Ⅱ地理区划，有黑线姬鼠分布，存在家野鼠混合疫源地；该线以南Ⅲ、Ⅳ地理区划，无黑线姬鼠分布，仅有家鼠型疫源地。家野鼠混合疫源地比仅家鼠型疫源地的流行程度强。黑线姬鼠构成比和带毒率越高的地区流行越强。健康人群隐性感染率家鼠型地区比野鼠型地区高。
本病流行因素除与地形地貌，主要宿主动物种类及带毒鼠EHF抗原携带率有关外，尚应考虑病毒毒力和带毒鼠种的密度。