【摘 要】
：
基因结构预测对于发现新基因、了解基因组结构规律具有重要作用, 是各类基因组计划的重要内容. 但对于真核生物, 现有基因预测方法的效果仍不理想. 为探讨多级优化的真核生物
【机 构】
：
华中科技大学计算机科学与技术学院,华中科技大学生命科学与技术学院,Laboratory of Bioinformatics
论文部分内容阅读
基因结构预测对于发现新基因、了解基因组结构规律具有重要作用, 是各类基因组计划的重要内容. 但对于真核生物, 现有基因预测方法的效果仍不理想. 为探讨多级优化的真核生物基因结构预测方法, 在将复杂的多基因结构预测问题划分为基因级(单外显子基因、多外显子基因)、元件级(外显子、内含子等)和特征级(功能位点信号、密码子使用偏好等)等多个层次上的一系列较简单子问题的基础上, 通过从简单到复杂进行逐级优化的策略, 建立了基因结构预测的多级模型, 设计了基因结构寻优的动态规划算法, 开发了真核生物基因结构预测系统GeneKey(1.0). 用广泛采用的数据集对该系统进行测试的结果表明, GeneKey(1.0)的预测精度在核苷酸、外显子和基因水平上均高于著名系统GENSCAN. Gene- Key(1.0)已提供网上服务(http://infosci.hust.edu.cn).
其他文献
在测井资料处理解释过程中 ,需要对井筒数据进行重采样。全局多项式和三次样条插值是目前常用的数值插值重采样方法 ,但存在计算量大、局部形变大等缺点。介绍了Akima分段三
目的克隆可溶性成纤维细胞生长因子受体-1(sFGFR-1)基因,并在快速翻译系统(RTS)中高效表达相应蛋白.方法培养Swiss Rat 3T3成纤维细胞株,提取总RNA,用逆转录-聚合酶链反应(RT
针对密闭容器内喷雾场PDA测量中一些关键问题 ,如实验光路调整、非正交光轴的正交化处理、测量窗的选择及其清洁、由于水滴直接打在测量窗口等原因引起水膜振动对测量结果的影响、PDA的测量数据可重复性和时效性进行了分析研究 ,得出的一些经验及结论对今后的PDA测量和使用具有指导作用
采用三种不同的计算格式对Mach数为6, 8, 10的高超音速边界层中的二维扰动的扰动演化做了直接数值模拟. 在入口处引入不同幅值的第二模态T-S波, 研究了小激波开始生成时扰动
通过使用有限元软件对大镜面进行模拟计算和分析,可以预先确定加工和装校支撑方法是否符合设计要求,从而有效地减少了设计的盲目性.分析计算了口径为1.2m的球面镜在不同工况
在采用MIL-1797-STD有人驾驶飞机飞行品质规范检验某第三代战斗机飞行品质过程中,在计算鹊克准则(即瞬时峰值比、上升时间及有效时间延迟)时,认为通过利用高阶系统传递函数求
针对传统的LMS在信号处理中的不足 ,提出利用RBF网络实现自适应滤波 ,并将其应用于管道噪声控制 .仿真结果表明 ,与LMS算法和WLMS算法相比 ,此方法具有良好的非线性噪声抑制
本文考虑一类半线性双曲系统的状态观测问题,给出了一个(求解)算法并证明了其在某种相当强的意义上的有效性.
提出了食品机械绿色设计的观点,讨论了食品机械绿色设计的内容,并建立了食品机械绿色设计综合评价体系的评价准则和评价指标.
叙述了现代空间相机对主镜的特殊要求。总结了主镜对空间相机性能具有重要影响的主要因素,即形状、材料、轻量化形式、支撑方式、微重力的影响和热尺寸稳定性等,并说明了在设