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医学检验中心是一个集科研、教学和医疗为一体的综合性临床医学实验室。2006年被评为南通市临床重点专科。目前设有9个专业实验室：生化检验实验室、血液检验实验室、免疫检验实验室、细菌检验实验室、急诊检验实验室、体液检验实验室、放射免疫检测中心、分子生物学实验室和中心实验室。在人才梯队、设备和医、教、研等各个方面已走在南通市市直医院的前列。现有专业技术人员35名，硕士4名，高级职称7名，省医学会检验学会委员1名，南通市医学会检验学会副主任委员2名，市“226”人才2名。