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对我国13个家驴品种367条序列(其中引用文献资料241条)的mtDNA D-loop区399bp进行分析,共检测到96种单倍型57个多态位点,其单倍型多样度为0.767~0.967,核苷酸多样度为0.014~0.032,表明我国家驴的遗传多态性丰富。与3个努比亚野驴、3个索马里野驴和6个亚洲野驴的序列构建NJ系统发育树,证明我国家驴的母系起源为非洲野驴中的索马里驴和努比亚驴,亚洲野驴不是中国家驴的母系祖先。