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兴凯湖自然保护区的鸟类有１６个目３９科１８０种．其中夏候鸟１２０种．占６６．７％、留鸟３５种．占１９．４％。从生态类型上分．水鸟６５种．占３６．１％；非水鸟１１５种．占６３．９％．从分类上分．雀形目鸟类７３种．占４０．６％；雁形目鸟类２５种、占１３．９％；集形目鸟类１７种．占９．４％；其余各国１８种、占１０．０％。从保护级别上分．中、日两国政府保护候鸟种类为１００种、占该协定种数的４８．５％，国家二级保护种类３０种．一级保护种类有丹顶鹤、东方白鹤、金雕、白尾海雕等４种。黑颈、红胸鸬鹚、黄嘴白鹭、红头鹚潜鸭