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绿脓杆菌（铜绿假单胞菌，PA）的主要耐药机制是产生哥内酰胺酶、菌细胞的外膜通透性降低及菌体蛋白结构与功能的变化。产生多种β-内酰胺酶，包括质粒介质的头孢菌素酶（AmpC）和金属酶等。产金属酶不仅能水解多种β-内酰胺类抗生素，对碳青霉烯类也不例外。近来还认为其耐药与改变青霉素结合蛋白靶位、低亲和力的青霉素结合蛋白（PBP）、细菌膜孔蛋白通道狭窄、生物被膜形成、主动外排（泵出系统）等有关。其外膜通透性降低，显示其对多种药物低敏感性，主动外排（泵出系统）是多重耐药的主要机制。