【摘 要】
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目的构建薏苡转录组数据库,为薏苡的功能基因挖掘、分子标记开发和遗传育种提供序列信息。方法取薏苡不同发育时期的各组织部位提取RNA,利用Illumina Hiseq 4000高通量测序平台进行测序,利用功能数据库进行基因功能注释和生物信息学分析。结果共获得65.57 Mb Clean reads,通过质量控制和De novo组装,获得76164个unigene,平均长度为1023 bp。与非冗余核酸序列数据库(NT)、非冗余蛋白数据库(NR)、蛋白质直系同源簇数据库(COG)、京都基因组百科全书(KEGG)
【基金项目】
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国家自然科学基金面上项目(No.81872972)。
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目的构建薏苡转录组数据库,为薏苡的功能基因挖掘、分子标记开发和遗传育种提供序列信息。方法取薏苡不同发育时期的各组织部位提取RNA,利用Illumina Hiseq 4000高通量测序平台进行测序,利用功能数据库进行基因功能注释和生物信息学分析。结果共获得65.57 Mb Clean reads,通过质量控制和De novo组装,获得76164个unigene,平均长度为1023 bp。与非冗余核酸序列数据库(NT)、非冗余蛋白数据库(NR)、蛋白质直系同源簇数据库(COG)、京都基因组百科全书(KEGG)
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