微卫星DNA(microsatellite DNA)标记已在动物和植物遗传变异分析和QTL定位方面普遍应用。许多研究者采用微卫星DNA标记在牛(Bos taurus)、羊(Capra hircus)、猪(Sus scrofa)、鸡(Gallus gallus)等基因组中筛选出了大量与生长发育或生产性能具有关联效应的等位基因,并应用于畜禽育种实践。然而,微卫星标记与宣汉牛(B.taurus)生长发育性状之间的关联效应尚未见相关研究报道。本研究采用12对微卫星引物,应用PCR扩增和非变性聚丙稀酰胺凝胶电泳技术,对42头宣汉牛母牛进行了遗传多样性检测,并统计分析各位点不同基因型群体宣汉牛在体高、体长、胸围、管围和体质量5个性状上的效应关系。结果显示,12个微卫星位点中,BM1905位点与宣汉牛体高、体长、胸围、管围和体质量不具有关联效应。IDVGA2、BM2113、ETH225、HEL9、ILSTS005、BM1824、ETH10位点与体高;BM2113、DVGA55、ETH225、HEL9、ILSTS005、BM1824、DAVG44位点与体长;BM2113、DVGA55、ETH225、HEL9、ILST093、IDVGA27、BM1824位点与胸围;BM2113、ETH225、HEL9、ILSTS005、BM1824、ETH10、DAVG44位点与管围;BM2113、DVGA55、ETH225、HEL9、ILSTS005、ILST093、BM1824位点与体质量均具有显著或极显著的效应关系。研究表明,除BM1905以外,其余11个微卫星位点上对宣汉牛生长发育性状具有正效应的等位基因有59个,具有负效应的等位基因44个。本研究在分子水平上为宣汉牛科学合理保种、早期选种和高效育种提供了理论依据,可应用于宣汉牛选育改良实践。