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目的
了解2015—2016年上海地区成人门诊急性腹泻病例中诺如病毒(norovirus, NoV)GⅡ型的基因分型及分子流行病学特征。
方法收集上海地区2015年3月至2016年12月912份成人急性腹泻粪便标本，采用一步法定量逆转录PCR方法检测NoV GⅡ型，并扩增开放阅读框1(open reading frame，ORF1)的聚合酶和ORF2衣壳区域进行测序分型。
结果2015年3月至2016年12月912份成人急性腹泻粪便标本NoV GⅡ型阳性检出率为17.76%(162/912)，其中2015年NoV GⅡ型阳性率为15.08%(65/431)，2016年阳性率为20.17%(97/481)，阳性标本中针对ORF1的RdRp区域和ORF2区域5′端均分型的标本为145份，共有10种型别，分别为GⅡ.Pe_GⅡ.4 Sydney 2012(60份)、GⅡ.P17_GⅡ.17(45份)、GⅡ.P16_GⅡ.13(10份)、GⅡ.P12_GⅡ.3(10份)、GⅡ.P7_GⅡ.6(9份)、GⅡ.P21_GⅡ.21(5份)、GⅡ.P16_GⅡ.4 Sydney 2012(2份)、GⅡ.Pe_GⅡ.17(2份)、GⅡ.P2_GⅡ.2(1份)、GⅡ.P7_GⅡ.14(1份)。
结论上海地区2015年春季主要流行GⅡ.P17_GⅡ.17，2015/2016年冬春季主要流行GⅡ.Pe_GⅡ.4 Sydney 2012和GⅡ.P17_GⅡ.17，而2016年秋季主要以GⅡ.Pe_GⅡ.4 Sydney 2012流行为主。进行持续的NoV暴发监测对于确定基因型分布的变化趋势和新毒株的发现非常重要。