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企业自主创新能力是国家自主创新能力的基础，要增强我国的自主创新能力，必须把大幅度提升企业自主创新能力放在突出地位。企业自主创新能力形成中的外部性、信息不对称以及风险不确定性等特征决定了政府财税制度激励的必要，发达国家经验也表明：政府财税制度激励是提高企业自主创新能力的重要手段。所以，应加大我国财税制度对企业自主创新能力提升的激励，包括：政府财政资金的投入诱导，政府采购制度的激励和税收优惠的激励。