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2013年9月及10月在镜泊湖26个采样位点共采集到浮游动物4门92种。其中，轮虫最多，为46种，占50%。浮游动物组成以桡足类剑水蚤占优，并且浮游动物群落结构存在明显的时空差异。调查期间，浮游动物的种类范围在0～35种，密度范围在0～192.5个/升；浮游动物的Margalef指数、Shanoon-Wienner指数以及Pieloud指数范围分别为1.41～5.19、1.42～3.52和0.42～0.98。整体而言，镜泊湖入湖口的水质要优于湖区和出湖口的水质。Pearson相关分析结果显示，镜泊湖动物群落分布受环境因子影响明显。整体上，水温、DO、化学需氧量、EC、藻类多样性、藻类种类及密度是影响镜泊湖浮游动物种群分布格局的主要因素，TN、NH3-N对浮游动物的分布影响也较大。