目的评价自体干细胞治疗对克罗恩病的疗效。方法检索 Pubmed、MEDLINE、EBSCO、Current Content Connect、Cochrane、中国生物医学文献数据库、中国知网、万方数据库、维普数据库、谷歌学术、全国图书馆参考咨询联盟等参考文献，检索年限1963年2月~2018年7月。由2位研究者独立进行数据搜集、评价纳入研究质量、进行资料提取及交叉核对后，对纳入的研究数据使用 RevMan 5.3 软件进行多因素分析，并进行Q检验鉴定研究间异质性, 根据Q检验结果分别采用随机效应和固定效应模型合并研究，同时根据统计项目的不同进行亚组分析。结果检索到相关论文共1048篇，排除动物实验、病例报道及个案，最终纳入13篇论文，其中9个回顾性研究、4个病例对照研究。荟萃分析表明，通过对单臂试验统计干细胞治疗前后总体病情缓解，共纳入9篇文献，分析总体人数与有效人数危险度差，经统计分析后干细胞治疗前后危险度差值有统计学意义（RD=0.81，P<0.00001）。通过进一步统计分析纳入文献经干细胞治疗前后OR值，差异有统计学意义（OR=11，P<0.00001），但克罗恩病疾病活动指数试验组与对照组差异无统计学意义（P=0.13）。结论自体干细胞治疗短期内可减轻克罗恩病患者临床症状，但其安全性及其疗效确切性，有待于进一步明确。