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洋葱伯克氏菌是一组表型相似但基因型不同的细菌群（Burkholderia cepacia complex，简称Bcc），它存在于水稻生境和医院中，了解水稻根围Bcc菌株基因型的地位对水稻微生物安全性具有重要的意义。以recA基因的HaeⅢ—RFLP技术和基因型特异性PCR扩增为主要方法对来自水稻根围的78株和来自医院的9株Bcc菌株进行了基因型分析。研究表明水稻根围存在Bcc菌株Ⅰ、ⅢB和Ⅴ基因型。其中Ⅴ型为优势菌；而在医院来源的Bcc菌株中，存在Ⅰ、ⅢA和ⅢB型，以ⅢA型菌株最多。这表明我国水稻根围和医