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“双一流”建设为地方高校及交叉学科发展提供了机遇,但囿于学科定位的现实困境,地方高校在发展上也面临挑战。从生态系统理论视角看,加强高校交叉学科建设是发展一流大学、一流学科的根本。交叉学科与“双一流”建设有内在的关联,应处理好交叉学科与争取一流学科、学科分层与学科分类、交叉学科建设与组织建制、资源配置及人才培养等关系,不断完善交叉学科的生态治理、结构治理、组织治理、资源配置方式和人才培养模式。