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目的
建立基于多重PCR技术的肠球菌万古霉素高水平耐药基因vanA、vanB、vanD和vanM的快速分型检测方法。
方法通过分析可介导肠球菌万古霉素高度耐药的D-丙氨酸∶D-乳酸(D-Ala∶D-Lac)连接酶基因序列差异,设计可同时检测肠球菌万古霉素高水平耐药基因vanA、vanB、vanD和vanM的多重PCR分型检测方法,以含vanA、vanB、vanD和vanM基因的重组质粒为阳性对照,以临床常见病原菌DNA为阴性对照,评价其敏感度及特异度。采用新建方法检测50株万古霉素耐药临床分离株,50株万古霉素耐药肠球菌(VRE)临床株于2006年1月至2014年12月分离自上海地区9家医院,并与常规PCR及测序方法比较。
结果vanA、vanB、vanD和vanM基因核苷酸序列一致率为60.8%~71.3%,根据序列差异建立的分型方法可对不同基因型阳性对照样品进行准确分型。所有阴性对照样品均未出现假阳性。检测50株临床分离VRE,18株为vanA型,32株为vanM型,与常规PCR及测序方法比较,敏感度及特异性度均为100.0%。检测下限2×10拷贝/PCR反应,检测可在3.5 h内完成。
结论建立了一种基于多重PCR技术的VRE万古霉素高水平耐药基因快速分型方法,可用于VRE菌株的分子流行病学研究及检测。