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卓越工程师教育培养计划实施的关键是形成校企深度合作关系。基于联盟自身的不稳定性，探索联盟互依平衡关系作用机理。主张联盟高校应依托产业技术创新战略联盟，共同攻关行业技术难题，交流教科研人员，共建共享优质资源，共同开展人才培养工作，形成动态稳定的校企互依平衡关系。依托产业技术创新战略联盟，建立由高校和企业高层管理人员共同组成的教学工作指导委员会，形成高校教师和企业管理人员互聘互访制度，共建共享教学与科研资源平台，加强实践教学基地建设，多渠道实现校企联合培养卓越工程师。