基于trnH-pbsA序列的8种葱属植物系统遗传多样性分析

来源 :分子植物育种 | 被引量 : 0次 | 上传用户:karrou
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本研究主要通过对薤白、蒜、大葱、香葱、蒙古韭、阿拉善韭、宽叶韭、黄花葱8种葱属植物trnH-pbsA基因片段进行PCR扩增并测序,使用clustalXl.83、MEGA6.06等软件进行序列分析并构建系统进化树.PCR扩增显示宽叶韭未检出条带,其余7种葱属植物的trnH-pbsA序列长度在618bp到626 bp之间,经MEGA6.06软件处理分析得到636个位点,序列中共501个保守位点,107个变异位点和104个简约信息位点.GC含量在34.9%~35.8%之间,种间的遗传距离在0.000~0.166之间,同源性在80%~99%之间.分子进化树表明,薤白与其余7种葱属植物分开,蒙古韭和阿拉善韭自展支持率为48%,蒜和香葱自展支持率为18%.薤白与其余7种葱属植物亲缘关系较远,大葱和香葱亲缘关系较近.
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