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目的：利用聚类分析对各地野生及家种丹参的指纹图谱数据进行分析。了解不同地理区域野生丹参以及同一地区家种丹参的遗传差异，为丹参药材优良品种的筛选提供依据。方法：采用高效液相色谱法，以甲醇-水系统为流动相进行梯度洗脱，流速1．0mL／min。检测波长254nm，使用SPSS11．0数据处理软件对所得指纹图谱中考察指标进行聚类分析。结果：采用无性繁殖的相同产地的家种丹参指纹图谱具有很好的相似性，相应的品系药材可以归入同一类；而野生丹参则不可按其地理区域归类。结论：采用无性繁殖丹参的遗传稳定性较好。