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哲学批判是培根哲学体系一个非常重要的特点,无论是他早年的作品《时代勇敢的产儿》和《各家哲学的批判》,抑或他晚期最为成熟的著作《新工具》,都以相当的篇幅进行哲学批判工作。培根对柏拉图、亚里士多德以及经院哲学的方法论都曾进行了严厉的谴责与批判,培根是在他的批评中体现了对被批判者的尊敬,在他们的基础上提出自己的哲学。