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大量微生物定植于动物肠道中,直接或间接地影响宿主的营养、发育、免疫和健康。为探究不同健康状态下棘胸蛙(Paa spinosa, David)肠道菌群结构,本文对13个健康(Health组)、19个患歪头病(WHD组)和18个患蓝眼病(BED组)的棘胸蛙肠道微生物总DNA进行16S rRNA V4-V5高变区测序。结果显示:共获得3984个总操作分类单元(Operational taxonomic units, OTUs),35个门,80个纲,155个目,283个科,501个属。α多样性结果表明,健康组的菌群丰富度显著高于患病组(P<0.05),患病组间的菌群丰富度差异不显著(Chao1指数:Health:1232.92; WHD:975.57; BED:1048.76);健康和患病组间微生物群落均匀度无显著差异(Shannon指数:5.27; 5.20; 5.41)。门分类水平分析发现:厚壁菌门(Firmicutes) (52.08%; 49.57%; 26.48%)、拟杆菌门(Bacteroidetes) (30.55%; 21.93%; 43.02%)、变形菌门(Proteobacteris) (15.55%;10.42%; 5.25% )是棘胸蛙肠道菌群的优势菌门。患病蛙肠道中的优势菌门及其丰度均发生变化,特别是脱铁菌门(Deferribacteres)在歪头病组和蓝眼病组棘胸蛙肠道中丰度显著上升(0.18%; 14.05%; 22.16%)(P<0.05)。属分类水平分析发现:拟杆菌属(Bacteroides) (29.70%; 16.09%; 21.76%)、丹毒丝菌科中未定义的一个属(An unclassified Erysipelotrichaceae) (21.38%; 6.92%; 4.94% )、毛螺科中未定义的一个属(An unclassified Lachnospiraceae) (12.23%; 15.98%; 4.43% )、柠檬杆菌属(Citrobacter) (10.31%; 6.19%; 1.10% )、真杆菌属(Eubacterium) (9.09%; 4.88%; 0.54% ) 是棘胸蛙肠道菌群优势菌属,但各组间的丰度差异显著;脱铁菌门的Mucispirillum在患病棘胸蛙肠道中丰度显著上升(0.17%; 13.89%; 21.94% ) (P<0.05)。研究表明:棘胸蛙肠道菌群结构与健康状态相关,且健康与患病棘胸蛙肠道菌群结构差异显著。