枸杞胆碱合成关键酶基因PEAMT的克隆及生物信息学分析

来源 :上海交通大学学报(农业科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:mavylin
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利用RT-PCR和RACE结合的方法,获得了枸杞磷酸乙醇胺N-甲基转移酶PEAMT基因cDNA全序列(命名为LbPEAMT)。LbPEAMTcDNA全长1 863bp,开放读码框1 497bp,编码一个由498个氨基酸构成的多肽,理论分子量为56.53kDa,等电点pI为5.50。通过多种序列比对,该基因编码的氨基酸序列与番茄PEAMT氨基酸的相似性为93%。二级结构预测LbPEAMT蛋白由44.98%的α-螺旋、17.67%的延伸链、6.63%的β-转角和30.72%的不规则卷曲组成。LbPEAMT是一个亲水蛋白。含有2个S-腺苷甲硫氨酸依赖催化活性结构域,分别位于N端65-164aa和C端290-392aa。每个活性区都包含有4个部分基序,分别为I、post I、post II和post III。LbPEAMT的这2个活性区在蛋白、磷脂和小分子甲基转移酶中都是相对保守的。
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