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反刍动物瘤胃是一个极其复杂的微生态系统,内含有大量细菌(细胞数约为1×10^11个/mL,包括200多个种)、纤毛虫(数量为1×(10^4-10^6)个/mL,包括25个属]、厌氧真菌(游离孢子数为1×10^3~1×10^5个/mL,包括6个属)和噬菌体[颗粒数为1×(10^7-10^9)个/mL]。瘤胃微生物生长需要复杂的营养因素和严格的厌氧环境,且某些菌的共生性很强。显微镜直接观察和分离培养比较的结果表明,在体外培养成活的细菌仅占瘤胃总细菌数的10%。