目的 对2018年内蒙古自治区(内蒙古)包头市土默特右旗引发流行性乙型脑炎(乙脑)疫情的蚊虫及虫媒病毒进行调查研究.方法 在包头市土默特右旗用诱蚊灯法采集蚊虫标本,形态学鉴定后分装编号,液氮保存.用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)检测蚊虫病毒,采用DNAStar等多种生物学信息软件对病毒核苷酸序列进行分子生物学特征分析.结果 2018年9月8-12日,在包头市土默特右旗共捕获蚊虫5种208 139只,其中背点伊蚊、淡色库蚊、三带喙库蚊、凶小库蚊、黄色伊蚊分别占捕获总数的46.56％、35.77％、8.12％、5.25％和4.30％.共研磨蚊虫标本198份,检测出2份黄病毒科阳性标本,基因测序结果显示1份为乙脑病毒(JEV)阳性,1份为Tahyna病毒阳性.对JEV阳性标本进行全基因测序,得到10 880 bp的全基因序列.利用病毒PrM区段(病毒基因组456～695位核苷酸)进行基因分型,确定JEV序列为基因Ⅰ型.与我国乙脑减毒活疫苗株SA14-14-2比对,核苷酸差异为12.59％,氨基酸差异为2.96％.结论 在内蒙古地区背点伊蚊中首次获得基因Ⅰ型JEV全基因组序列.