【摘 要】
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目的:分析华重楼种子休眠解除前后基因表达谱的变化情况,为探究其种子休眠解除相关基因提供基础数据.方法:对解除休眠前后的种胚分别取样,采用转录组测序技术进行测序分析.结果:产生24.46 Gb原始数据,组装并去冗余后拼接出Unigenes 262556条,注释到7大功能数据库(GO、KEGG、KOG、NR、NT、Pfam、Swiss-Prot),分别有123077(NR:46.88％)、41785(NT:15.91％)、87811(Swiss-Prot:33.44％)、118996(KOG:45.32％)、
【机 构】
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南京农业大学园艺学院,江苏 南京 210095;中国医学科学院北京协和医学院/药用植物研究所,北京100193
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目的:分析华重楼种子休眠解除前后基因表达谱的变化情况,为探究其种子休眠解除相关基因提供基础数据.方法:对解除休眠前后的种胚分别取样,采用转录组测序技术进行测序分析.结果:产生24.46 Gb原始数据,组装并去冗余后拼接出Unigenes 262556条,注释到7大功能数据库(GO、KEGG、KOG、NR、NT、Pfam、Swiss-Prot),分别有123077(NR:46.88％)、41785(NT:15.91％)、87811(Swiss-Prot:33.44％)、118996(KOG:45.32％)、97738(KEGG:37.23％)、61387(GO:23.38％)以及103057(Pfam:39.25％)条Unigene得到功能注释.通过GO分类和KEGG Pathway富集性分析,分别归于58个GO类别和168条代谢途径.DEG分析结果显示,种子在休眠解除过程中,上调DEG数目(56426)显著大于下调DEG数目(12822).在对华重楼种胚休眠解除前后的样品进行转录组测序中发现28491个SSR位点,最多的为二核苷酸SSR,为16093个.结论:华重楼种子休眠解除过程中有多个基因参与、多个生物过程协同调控,这些注释信息的完成为华重楼种子休眠解除相关候选基因的挖掘提供了数据资源.
其他文献
目的:优选银柴退热口服液的最佳制备工艺并进行中试生产研究.方法:比较冷藏静置法、高速离心法、水提醇沉法、澄清剂沉淀法4种澄清工艺对银柴退热口服液中绿原酸、黄芩苷相对含量的影响,同时考察固化物的含量和精制澄清72 h后的提取液沉淀情况,以权重分别为0.4、0.4和0.2进行综合评分确定澄清方法;对不同配比的矫味剂、不同pH值及不同的灭菌方法进行考察,结合中试生产试验结果,建立银柴退热口服液的制备工艺,确定主要技术参数及辅料的种类和用量.结果:银柴退热口服液主要工艺参数为:澄清工艺为一次醇沉,醇浓度为70％;
目的:测定白芍及不同炮制程度酒白芍色度值,并对其与炮制工艺参数进行相关分析.方法:采用色差仪测定白芍及不同炮制程度酒白芍的色度值L?、a?、b?,计算其双侧90％参考范围,并进行主成分分析.利用SPSS 21.0软件建立L?、a?、b?与炮制温度、炮制时间的非标准化典则判别函数式.采用红外光谱技术分析生白芍与不同炮制程度的酒白芍中化学基团的变化情况.结果:酒白芍炮制适中品色度值双侧90％参考范围为0.40≤a?≤0.67,并建立了非标准化典则判别函数式.红外光谱显示白芍酒炙后诱导效应减弱、共轭效应增强.结
目的:建立HPLC法同时测定16种33批五加属植物中apigenin-6,8-C-di-β-D-glucopyranoside、芦丁、金丝桃苷、柚皮苷、芹菜素-7-O-新橙皮苷、大波斯菊苷、槲皮素、芹菜素、山柰素、异鼠李素10种黄酮类成分的含量.方法:采用Promosil C18(250 mm×4.6 mm,5μm)色谱柱;流动相为乙腈-0.1％磷酸溶液,梯度洗脱;流速为1.0 mL/min;柱温为30℃;检测波长为283 nm.结果:10种成分在相应的浓度范围内与峰面积的线性关系良好,R2>0.9991
目的:建立药用大黄UHPLC指纹图谱,并结合化学计量学进行质量评价.方法:采用Waters CORTECST3(150 mm×2.1 mm,1.6μm)色谱柱;流动相为甲醇-0.1％磷酸溶液,梯度洗脱;流速为0.25 mL/min;检测波长为260 nm;柱温为30℃.通过聚类分析、主成分分析和正交偏最小二乘判别分析对21批药用大黄进行质量评价.结果:建立了药用大黄UHPLC指纹图谱,确定了24个共有峰;聚类分析和主成分分析结果一致;主成分综合得分结果表明同一产地样品质量也存在差异.正交偏最小二乘判别分析
目的:研究珠芽蓼茎叶的化学成分.方法:采用各层析色谱法对珠芽蓼茎叶提取物进行分离纯化,根据理化常数和光谱常数进行结构鉴定.结果:从珠芽蓼茎叶中分离并鉴定了11个化合物,分别为:扁蓄苷(1)、番石榴苷(2)、槲皮素-3-O-β-D-木糖(1→2)-α-L-鼠李糖苷(3)、异槲皮苷(4)、槲皮苷(5)、山柰酚-3-O-β-D-葡萄糖苷(6)、木犀草素-7-O-β-D-葡萄糖苷(7)、金丝桃苷(8)、绿原酸(9)、新绿原酸(10)、没食子酸(11).结论:其中,化合物1～4、7、8为首次从该植物中分离得到.
目的:改良现行川牛膝质量标准方法的TLC鉴别并新增HPLC-ELSD法,以弥补川牛膝类药材鉴定方法的不足.方法:以川牛膝伪品麻牛膝所含特征性皂苷类成分为线索,依据泡沫实验、TLC鉴别及HPLC-ELSD法建立川牛膝及其伪品的鉴别方法,并对所收集的11批川牛膝、21批麻牛膝及7批杂牛膝样品进行鉴别.结果:泡沫实验中麻牛膝所产生的泡沫最多,其次为杂牛膝,川牛膝最少.TLC鉴别中所有批次的川牛膝均不显与牛膝皂苷Ⅰ、牛膝皂苷Ⅱ对照品相一致的黄绿色荧光斑点,且未有与川牛膝对照药材不一致的黄绿色斑点.麻牛膝及杂牛膝与
目的:建立黄花倒水莲毛状根及其愈伤组织的诱导体系,测定毛状根愈伤组织总皂苷含量.方法:利用发根农杆菌ATCC11325、LBA9402、R1000、A4、R1601感染黄花倒水莲叶片和茎段产生毛状根,考察不同菌株对黄花倒水莲叶片和茎段诱导毛状根能力;同时,以叶片诱导获得的毛状根为外植体诱导愈伤组织,并测定愈伤组织总皂苷的含量.结果:5种农杆菌均能诱导出毛状根,黄花倒水莲叶片诱导率高于茎段,其致根能力大小顺序依次为LBA9402>A4>ATCC11325>R1000>R1601;培养基MS+2.0 mg/L
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目的:基于西沙群岛植物资源调查工作,对西沙群岛药用植物资源的特点进行评估,为今后对该地药用植物资源的科学保护和合理利用提供参考.方法:通过实地调查、标本采集、文献查阅等方法,对西沙群岛药用植物资源开展调查,并对药用植物的分布、种类、功效、药用部位等数据进行整理分析.结果:西沙群岛共有药用植物350种,隶属86科251属;按分布统计,永兴岛药用植物种类最多,共309种,占总数88.29％;按生活型统计,1～2年生草本药用植物种类最多,共123种,占总数的35.14％;按药用部位统计,全草(株)入药的种类最多
目的:建立醋北柴胡的HPLC指纹图谱分析方法,为醋北柴胡饮片质量控制提供参考.方法:采用HPLC法建立醋北柴胡指纹图谱,运用化学模式识别法评价醋北柴胡的质量控制相关指标.结果:建立了22批醋北柴胡样品指纹图谱,确定了16个共有峰,22批样品相似度为0.512～0.965.经过主成分分析确定4个主成分是影响药材样品质量评价的主要因子;16个共有峰中对样品组分起关键作用的成分为3、6、9(柴胡皂苷d)、4(柴胡皂苷a)、14、2(柴胡皂苷f)、11和13.结论:利用HPLC法建立的醋北柴胡饮片的指纹图谱准确可